与字面解经法（或实意解经）相反的是寓意解经法，又称为隐喻或者灵意解经。此方法总是意图找出经文中的秘密（密码）或者隐藏的含义，而通常这些被找出来的“秘密”是与经文的真实意义没有多大关系的。

例如，有人在解释路10:25-37“好撒玛利亚人”的比喻时，将“油和酒”灵意解释为“圣灵的膏抹”，将“二钱银子”解释为“新旧约圣经”，将“客店”解释为“教会”，将“店主”解释为“使徒保罗”，当然没有忘记“好撒玛利亚人”，他就是耶稣基督。于是整个故事就变得格外的精彩：耶稣将落在罪中的人拯救之后，交在教会中，又将新旧约圣经托付给使徒保罗，让他照顾教会。一个小小的比喻骤然间变成了一个史诗般的宏大叙事。但是，却遮蔽了此比喻最初要探讨的“爱邻舍如同自己”的这一简单教导。

所以，当我们将一段经文过分灵意化的时候，请原谅我的直接，我们就是在说一个“属灵的谎言”，并且还遮蔽了神话语真实的意义了。

寓意或灵意解经法所暴露出来的问题有以下几个：

第一，正如我们刚刚所强调的，且是最重要的一点，就是隐藏了经文的真正意义。而且，我们不单无法了解经文本身的意义，无法遵守其教训，还让自己活在一种自欺的属灵中，甚至自以为发现了别人未曾发现的真理，以至于产生属灵的骄傲。

第二，寓意或灵意解经所暴露出的另一个问题是，解经者过分主观与个人化。就如同在一些信徒群体中常常过分强调所谓的“个人领受”，以至于当一些人对某一段经文的“领受”不同，甚至彼此冲突的时候，就会给信徒团契造成不必要的伤害，乃至于分裂。而这种所谓的“个人领受（灵意解经）”，因为过于主观，而无法衡量其准确性，这也为可能出现的争执埋下了伏笔。

第三，寓意或灵意解经会削弱我们了解经文真理的能力，这就好像戴上了一幅有色眼镜，这眼镜会遮掩住一些内容，同时又会突显出一些内容，久而久之，我们就会习惯于发掘字面背后的隐意，却对经文明显的意义视而不见。

第四，当我们常常用寓意和灵意解经时，会让他人对经文事实的可靠性产生质疑。就如同我们上面所讲的“好撒玛利亚人”的比喻，若是我们用上文中的灵意去解释此段经文，就等于我们在借着“好撒玛利亚人”的故事，去讲另外一个完全不同的故事，那么就会让他人对于耶稣的教导产生质疑，因为明显此故事照着字面去了解与灵意化的解释完全不同！

最后，我们需要谨记的是，每一段经文只有一个正确的解释或意义，却可能有多个应用方式。但是寓意解经的随意性，却会让一段经文拥有许多完全不同的解释。我们需要牢记神的话语吩咐我们的，“所吩咐你们的话，你们不可加添，也不可删减，好叫你们遵守我所吩咐的，就是耶和华──你们神的命令。”（申4:2）